این برنامه با استفاده از مقاله Parallel Clustering Algorithm for Large-Scale Biological
Data Sets پیاده سازی شده است ./
کد برنامه پیاده سازی مقاله الگوریتم خوشه بندی موازی برای مجموعه داده های زیست شناسی مقیاس-بزرگ با استفاده از CUDA نوشته شده در اختیار شما قرار داده می شود . به همراه توضیحات کد در اختیار شما قرار داده خواهد شد ./
توجه : ترجمه مقاله ای که پیاده سازی بر اساس ان انجام شده در سایت موجود است /
مقاله اصلی را به زبان انگلیسی می توانید رایگان از اینجا دریافت کنید . /
چکیده
پیش زمینه: گسترش انفجاری داده های زیست شناسی در سال های اخیر چالشی بزرگ برای الگوریتم های خوشه بندی سنتی بوجود آورده است. با افزایش مقیاس مجموعه داده ها، به حافظه های بزرگتر و زمان اجراهای طولانی تری برای مسایل شناسایی خوشه نیاز است. الگوریتم انتشار همریشگی (affinity propagation) عملکردی بهتر از بسیاری دیگر از الگوریتم های کلاسیک خوشه بندی دارد و بصورت گسترده در پژوهش های زیست شناسب بکار گرفته می شود. با این حال به هنگام پرداختن به مجموعه داده های دارای مقیاس بزرگ پیچیدگی زمانی و فضایی به تنگنا و محدودیت عمده ای تبدیل می شود. با این حال ماتریس شباهت که رویه های ساختن آن زمان اجرای زیادی می طلبد، پیش از اجرای الگوریتم انتشار همریشگی مورد نیاز است، چرا که این الگوریتم مجموعه داده ها را بر پایه ی مجموعه شباهت میان جفت داده ها خوشه بندی می کند.
کد برنامه پیاده سازی مقاله الگوریتم خوشه بندی موازی برای مجموعه داده های زیست شناسی مقیاس-بزرگ با CUDA
