دانلود مقاله اثر باکتری های تثبیت کننده نیتروژن بر جوانه زنی زیره سبز

اختصاصی از سورنا فایل دانلود مقاله اثر باکتری های تثبیت کننده نیتروژن بر جوانه زنی زیره سبز دانلود با لینک مستقیم و پر سرعت .

زیره سبز از خانواده چتریان و جنس سیمینوم یکی از مهمترین گیاهان داروئی می با شد که در ایران از سطح زیر کشت مناسبی برخوردار است با تقاضای روزافزون برای داروها و مواد بهداشتی و آرایشی با منشا طبیعی اهمیت کشت و کار این گیاهان روز به روز افزایش می یابد در بر نامه تولید برای هر محصول ثبات و پایداری کشت از اهمیت زیادی برخوردار می با شد در کشت گسترده گیاهان داروئی مسلما این مقوله باید در نظر گرفت ضرورت پایداری در کشاورزی به دلیل اهمیت سه موضوع است اولین موضوع ایجاد در آمد کافی ؛ دومین موضوع افزایش قابلیت دسترسی غذا و مصرف آن و سوم؛ حفاظت و بهبود منابع طبیعی می با شد با توجه به محدود بودن منابع ؛ استفاده از باکتری تثبیت کننده نیتروژن (ازتوباکتر) که امروزه در زراعت گندم به صورت رایج مرسوم شده است با توجه به اینکه این باکتری شرایط جذب نیترو÷ن ؛ همچنین شرایط های نامساعد دیگر مانند تنش های شوری و خشکی و حتی مقابله با بر خی از قارچ های خاکزی را بهبود می بخشد از طرفی باعث صرفه جوئی در مصرف نیتروژن و نیز در نهایت افزایش عملکرد 15 تا20 در صدی در زراعت گندم شده است لذا در این طرح با توجه به این امر و امکان استفاده از این باکتری در زراعت زیره سبز در شرایط آزمایشگاهی بر روی زیره سبز و اغشته کردن بذر زیره با نسبت های 1 ؛2؛3؛4؛ کیلوگرم و تیمار شاهد بدون آغشته کردن بذر با باکتری انجام گرفت تیمار ها عبارت بودند از ؛تیمار A:تیمار شاهد بدون آغشته کردن با باکتری فقط با شستشو تیمار B آغشته کردن با باکتری با نسبت 1 کیلو گرم ( 75/1 گرم برای هر کیلو گرم بذر زیره ) تیمار C آغشته کردن بذر با باکتری با نسبت 2 کیلو گرم ( 25/3 گرم در هرکیلوگرم بذر زیره سبز ) تیمار D آغشته کردن با با کتری با نسبت 3 کیلوگرم ( 5 گرم در هر کیلو گرم بذر زیره سبز ) تیمار E آغشته کردن با باکتری با نسبت 4 کیلوگرم ( 25/6 گرم در هر کیلوگرم بذر زیره سبز ) طرح در غالب طرح کاملا تصادفی در شرایط آزمایشگاهی انجام شد که در تمام تیمار ها بذر ها پس از آبشوئی به مدت 24-36 ساعت وپس از خشک کرد ن ؛ با با کتری ها بذر با نسبت های فوق با استفاده از حریره نشاسته و شکر (ساکاروز) اغشته شد فاکتور هایی که در این طرح مورد بررسی قرار گرفت 1- در صد جوانه زنی 2- سرعت جوانه زنی 3- وزن ریشه چه (خشک ) 4- وزن تر ریشه چه 5- طول ریشه چه 6- 50% جوانه زنی نتایج با نرم افزار MSTATC و نرم افزار EXCELLمورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت سپس نتیجه گرفته شد که در بین تیمار ها درصد جوانه زنی ؛طول ریشه چه و وزن تر ریشه هیچ اختلاف معنی داری وجود نداشت ولی بین تیمار C و بقیه تیمار ها اختلاف معنی داری دیده شد بین تیمار های A,C از نظر سرعت جوانه زنی اختلافی دیده نشد اما بین تیمار های دیگر اختلاف دیده شد در فاکتور 50% جوانه زنی بین تیمار E و دیگر تیمار ها اختلاف معنی داری دیده شد نتایج نشان می دهد که آغشته کردن باکتری با بذر در تمام مقادیر بالا( بجز C) بر روی در صد جوانه زنی و طول ریشه چه و وزن تر ریشه چه هیچ تفاوتی ندارد اما روی سرعت جوانه زنی و 50% جوانه زنی بین تیمار ها اختلاف مشاهده شد بنابراین بهترین مقدار باکتری 4 کیلوگرم می با شد وبرای اغشته کردن با بذر زیره سبز توصیه می شود اما آزمایش های مزرعه ای نیز ضرورت دارد

کلمات کلیدی : زیره سبز ؛ باکتری ازتوباکتر ؛ گیاهان داروئی ؛ خواب بذر ؛

مقدمه و اهداف :
زیره سبز با نام علمی (Cuminum Cyminum ) متعلق به خانواده جعفری و از مهمترین گیاهان داروئی می با شد که در ایران ودر جهان از اهمیت خاصی بر خوردار می با شد اهمیت و جذابیت گیاهان داروئی اگر چه در گذشته وجود داشته اما با اثرات بد و ناگواری که از داروهای شیمیایی به جا گذاشته شد امروزه از اهمیت خاصی بر خوردار می با شند کشت وکار وسیع گیاهان داروئی از بر نامه های کشور های جهان می با شد با توجه به پتانسیل خوبی که در ایران به لحاظ کشت این گیاه وجود دارد و از طرفی حساسیت خاصی که این گیاه به استفاده کود ها دارد لذا در بر نامه تولید این گیاهان که تا امروز به صورت نوپا و گسترده نمی با شد باید به تعادل و مصرف صحیح کود های شیمیایی به خصوص کود های نیتروژنه توجه زیادی نمود در کشاورزی پایدار و با گسترش بیوتکنولوژی برای مصرف بهینه و ثبات کشت و خاک به عنوان یک مسئله با اهمیت استفاده از با کتری های تثبیت کننده ازت چه به صورت همزیست و غیر همزیست رایج شده است در زراعت های مهم واستراتژیکی مانند گندم ؛ امروزه استفاده از این با کتری به همراه کشت و آغشته کردن با بذر نتایج بسیار سودمند و قابل توجهی در جهت افزایش تولید ؛ و تحمل بهتر شرایط نامساعد و حتی تحمل بهتر بیماری ها انجام شده است لذا در مقاله زیر با الهام از این نتایج و با حفظ بهتر حاصلخیزی و خصوصیات خاک نسبت به آغشته کردن بذر زیره سبز با با کتری تثبیت کننده ازت که در غالب بسته های یک کیلوئی در بازار ها و خدمات کشاورزی توزیع می شود اقدام گردید لذا ابتدا اثرات این باکتری در شرایط آزمایشگاهی بررسی شد سپس در شرایط زراعی نیز انجام گرفت که به دلیل پایان نیافتن دوره رشد گیاه از ذکر نتایج این آزمایش خودداری می شود

مواد وروش ها :
این طرح به منظور بررسی و امکان تلقیح با کتری تثبیت کننده ازت ( غیر همزیست ) که در غالب بسته های یک کیلوئی تحت نظارت شرکت خدماتی توزیع می شود در شرایط آزمایشگاهی بر روی مر حله جوانه زنی گیاه زیره سبز انجام شد طرح مورد نظر در غالب طرح کاملا تصادفی که تیمار ها عبارت بودند از :1- شاهد بذر بدون تلقیح با باکتری 2- تیمار آغشته کردن بذر با نسبت 1 کیلوگرم 3- تیمار آغشته کردن بذر با نسبت 2 کیلوگرم 4- تیمار آغشته کردن بذر به نسبت 3 کیلوگرم 5- تیمار آغشته کردن بذر با نسبت 4 کیلوگرم ؛ نسبت های فوق بر حسب هکتار محاسبه شده است تیمار ها در چهار تکرار در شرایط آزمایشگاهی در درون دستگاه جوانه زنی برای مدت 20 روز در دمای 9 در جه و رطوبت 60 در صد صورت گرفت قبل از شروع آزمایش به علت دوره خواب بذر ؛ برای مدت 36 ساعت در آب غوطه ور کردیم که در این مدت چندین بار آب را تعویض می شد سپس پس از این مدت بذر ها را در سایه خشک کرده و به تعداد 25 عدد در هر پتریدیش گذاشته شد و عمل آبیاری با آب مقطر در مواقع لزوم داده می شد توضیح اینکه به علت کند بودن جوانه زنی این بذر مدت جوانه زنی بذر را 20 روز در نظر گرفتیم برای آغشته کردن بذر با با کتری ؛ ابتدا میزان با کتری که با ید برای این مقدار بذر آغشته شود را توزین کرده سپس با نشاسته حریره ای به همرا ه شکر تهیه کرده سپس حریره را خنک کرده و با آرامی به بذر مورد نظر اضافه می کنیم در خلال اضافه کردن حریره به آرامی با کتری ها با بذر مخلوط می کنیم وبه آرامی بذر را با باکتری مخلوط می کنیم سپس برای مدت نیم الی یک ساعت بذر ها را در برابر هوای آزاد گذاشته تا کاملا خشک شوند ( تهیه حریره برای افزایش سطح تماس بذر با با کتری می با شد ) سپس از هر بذر 25 عدد شمرده و در پتریدیش ها قرار می دهیم برای اینکه با کتری ها از آسیب نور در امان با شند پتریدیش ها را در کاغذ المونیوم پیچیده شد ضمنا بذر مورد استفاده از بذر های بومی بودند تیمار هایی که در این طرح مورد بررسی قرار گرفتند عبارتند از1- وزن تر ریشه چه 2- وزن خشک ریشه چه3- در صد جوانه زنی4- سرعت جوانه زنی5- طول ریشه چه 6- مدت زمان که 50 در صد بذر ها جوانه می زنند که در روز 20 از هر پتریدیش 3 گیاه را انتخاب کرده و طول ساقه چه ؛ طول ریشه چه ؛ و وزن خشک ریشه چه را توزین می کنیم و در مدت این 20 روز سرعت جوانه زنی ؛ در صد جوانه زنی و 50 در صد جوانه زنی را نیز اندازه می گیریم سپس نتایج را با استفاده از نرم افزار MSTATC و نمودار ها را با excel رسم شد

نتایج و بحث :
1-در صد جوانه زنی : نتایج نشان می دهد که از نظر آماری بین تیمار ها هیچ اختلاف معنی داری در سطح 5% وجود ندارد بنابراین آغشته کردن بذر با با کتری در در صد جوانه زنی اثری نداشته است جوانه زنی یک گیاه به عوامل درونی وبیرونی بذر مر بوط می با شد شرایط بیرونی برای تمام تیمار ها یکسان بوده است
میکروار گانیسم های موجود در خاک در بر خی موارد باعث بهبود شرایط جوانه زنی می شوند گاهی اوقات با خراش دهی و یا با تر شح بر خی مواد ترشحی مانند هورمون ها ؛ اسید ها و غیرو می توانند بر جوانه زنی موثر با شند با کتری غیر همزیست با تر شح ایندول اسید ثابت شده است که خروج گیاهچه را از بذر و جوانه زنی را در بر خی گیاهان مانند گندم را بیشتر می کنند (2)

اثر آغشته کردن باکتری در نسبت های مختلف بر در صد جوانه زنی
تیمار شاهد تیمار B تیمار C تیمار D تیمار E
A A A A A

2- طول ریشه چه :
از نظر آماری بین تیمار های مختلف در سطح 5% هیچ اختلاف معنی داری وجود ندارد

اثر آغشته کردن با کتری در نسبت های مختلف بر طول ریشه چه
تیمار شاهد تیمار B تیمار C تیمار D تیمار E
A A A A A

3- سرعت جوانه زنی : از نظر آماری بین تیمار A,C اختلاف معنی داری در سطح 5% در صد مشاهده نشده است اما بقیه تیمار ها اختلاف معنی داری مشاهده شده است بیشترین مقدار سرعت جوانه زنی مربوط به تیمار E و کمترین مقدار مر بوط به تیمار D می با شد لذا با افزایش نسبت با کتری سرعت جوانه زنی گیاه افزایش یافته است افزایش سرعت جوانه زنی باعث بهره گیری بیشتر گیاه از نور و افزایش راندمان فتوسنتز و در نهایت افزایش عملکرد خواهد شد از طرفی به لحاظ نبودن ار قام اصلاحی در ایران و کند بودن سرعت جوانه زنی زیره سبز اثر آغشته کردن با کتری ها با دوز های بالا (5 کیلوگرم ) بسیار موثر بوده است ( 1 )

فرمت این مقاله به صورت Word و با قابلیت ویرایش میباشد

تعداد صفحات این مقاله  17  صفحه

پس از پرداخت ، میتوانید مقاله را به صورت انلاین دانلود کنید

دانلود مقاله باکتری ها

اختصاصی از سورنا فایل دانلود مقاله باکتری ها دانلود با لینک مستقیم و پر سرعت .

فرمت فایل : ورد قابل ویرایش

تعداد صفحات: 62

فهرست مطالب:

 مقدمه     
عفونت های دستگاه فوقانی     
آنژین     
عفونت های ادراری     
اسهال     
مخملک     
مشمشه     
سیاه زخم     
مسمومیت غذایی     
مسمومیت غذایی ناشی از غذاهای کنسرو شده     
تب مالت (بررسلا)    
طاعون     
وبا     
حصبه (تیفوئید) یا تب روده ای     
سل     
کزاز     
پوسیدگی دندان     
لژنیلوزیس    
سیاه سرفه     
دیفتری (خناق)     
پنومونی (ذات الریه)  

چکیده:

تاریخچه

زمانی مردم گمان می‌کردند که غذای مانده به‌این دلیل خراب می‌شود که به قارچ و میکروب (باکتری) تبدیل می‌شوند. لویی پاستور(1822-1895)، دانشمند فرانسوی، نشان داد که غذا را میکروب‌های موجود در هوا فاصد می‌کند نه تغییر ماهیت آن. وی غذای تازه پخته شده را در دو ظرف شیشه‌ای تمیز گذاشت؛ در یکی را بست و در دیگری را باز گذاشت تا هوا وارد آن شود، فقط غذای ظرف در باز فاسد شد.

پریسا سیاهسنگی

بعضی از باکتری‌ها به صورت انفرادی و برخی از اقسام کروی به صورت گروهی (دو تا دو تا، ریشه‌ای و خوشه‌ای) زندگی می‌کنند.‌این نوع زندگی گروهی را کلونی می‌گویند. کلونی بعضی از اقسام باکتری‌ها چنان بزرگ است که با چشم دیده می‌شود. کلونی باکتری‌ها از لحاظ شکل و رنگ فرق دارند و حتی از روی آن، می‌توان باکتری را شناسایی کرد.

تغذیه:

همة‌جانداران برای انجام فعالیتهای حیاتی، به ماده و انرژی نیاز دارند. از‌این‌لحاظ، بین جانداران کامل مانند شما و یک باکتری ساده فرقی وجود ندارد. غذا، دارای ماده و انرژی است. باکتریها از لحاظ نوع گرفتن غذا و استفاده از آن، بسیا مختلف اند. بعضی، غذای خود را می‌سازند و برخی، به غذایی که توسط جانداران دیگر ساخته شده وابسته اند. حتی نوع استفاده از انرژی موجود در غذا هم در‌این جانداران مشابه نیست.

بعضی از باکتری‌ها اتوتروف هستند، یعنی می‌توانند غذای خود را بسازند. گروهی از باکتری‌های اتوتروف به کمک نور خورشید غذاسازی می‌کنند به‌این گروه فتوسنتز کننده می‌گویند. گروهی دیگر بدون استفاده از انرژی نور کار غذا سازی را انجام می‌دهند. به‌این گروه شیمیوسنتز کننده می‌گویند.‌این باکتری‌ها انرژی لازم برای غذاسازی را از مواد شیمیایی مانند گوگرد، آهن یا نیتروژن می‌گیرند.

بیشتر باکتری‌ها هتروترف هستند. جانداران هتروترف انرژی لازم را از غذایی می‌گیرند که توسط جانداران دیگر ساخته شده است‌این جانداران، نمی‌توانند غذاساز باشند، باکتری‌های هتروترف مواد غذایی خود را در خارج سلول گوارش می‌دهند، سپس مواد گوارش یافته، که به ذرات کوچکتری تبدیل شده اند، وارد سلول می‌شوند.

بعضی از باکتری‌های هتروترف ساپروفیت اند. ساپروفیت، جانداری است که از بقایای بدن موجودات زنده تغذیه می‌کنند. باکتری‌هایی که روی برگهای ریخته شده از درختان، یا مواد غذایی خود ما زندگی می‌کنند، از‌این جمله اند.

گروهی از باکتری‌های هتروترف انگل هستند. انگل، موجودی است که در داخل یا روی بدن یک جاندار دیگر به سر می‌برد و غذای خود را از بدن آن می‌گیرد. باکتری‌هایی که باعث پوسیدگی دندان،‌ایجاد جوش یا بیماری‌های مختلف در بدن ما می‌شوند، از‌این قبیل اند.

گرفتن انرژی از غذا: همه جانداران، چه اتوترف باشند و چه هتروترف، انرژی لازم را از غذا می‌گیرند. اما راه انجام‌این کار در آنها مشابه نیست. مثلاً، گروهی از باکتری‌ها به کمک اکسیژن هوا تنفس می‌کنند. اکسیژن، با غذا که به صورت ماده قندی است، ترکیب می‌شود و در نتیجه، انرژی نهفته در غذا آزاد می‌شود.

گروهی دیگر از باکتری‌ها ، انرژی غذا را از راه تخمیر به دست می‌آورند. تخمیر هم در واقع نوعی تنفس است که به اکسیژن هوا نیازی ندارد. در‌این فرایند، همة انرژی موجود در غذا آزاد نمی‌شود یعنی از تنفس معمولی، کمتر انرژی حاصل می‌آورد. در فرآیند تخمیر، باکتریها ماده‌ی قندی را فرآورده‌های مختلفی تبدیل می‌کنند که اسید و الکل از آن جمله است. از قدیم در کشور ما برای تهیه سرکه، از همین فرایند استفاده می‌شده است، تهیه ماست هم با روش تخمیر صورت می‌گیرد.

  تولید مثل

یک باکتری در فاصلة 20 دقیقه به حداکثر رشد خود می‌رسد و قادر به تولید مثل می‌شود. روش تولید مثل باکتری‌ها، تقسیم دوتایی است، در شرایط مساعد محیطی، باکتری با سرعت عجیبی تکثیر حاصل می‌کند. مثلاً یک باکتری بعد از 20 دقیقه به دو باکتری تبدیل می‌شود و 20 دقیقه بعد، از آن دو باکتری، چهار باکتری به وجود می‌آید و به همین نحو ادامه می‌یابد.

اگر‌این روش تکثیر باکتریها تا 24 ساعت ادامه یابد، از یک باکتری توده‌ای از باکتری‌ها به وزن 2000 تن به وجود خواهد آمد! البته عملاً چنین اتفاقی نمی‌افتد، زیرا آب و مواد غذایی لازم به زودی در محیط زندگی آنها تمام می‌شود و باکتری‌ها دیگر قادر به تولید مثل نخواهند بود. در ضمن، وقتی که جمعیت باکتری‌ها زیاد می‌شود، موادی از قبیل: الکل، اسید و … ترشح که برای خودشان مضر است. تجمع‌این مواد در محیط، خود سبب کاهش میزان تولید مثل باکتری‌ها خواهد بود . حتی زمانی فرا می‌رسد که میزان مرگ و میر بیش از میزان تولید مثل می‌شود.

هاگ سازی راهی برای زنده ماندن:

بیشتر باکتری‌ها در محیطی بهتر زنده می‌مانند که علاوه بر دارا بودن غذا، گرم و مرطوب نیز باشد در غیر‌این صورت باکتری می‌میرد. اما بعضی از باکتریها در شرایط نامساعد،‌هاگ درونی می‌سازند.‌هاگ درونی شامل پوسته‌ای سخت است که در داخل دیوارة باکتری تشکیل می‌شود. مواد سلولی باکتری در داخل‌این پوسته محفوظ می‌مانند و در برابر گرما، خشکی هوا و انجماد، از بین نمی‌روند.‌هاگ درونی می‌تواند سالها باقی بماند و تا هنگامی‌که دوباره شرایط محیط مناسب شود، باکتری را زنده نگه می‌دارد. در‌این حال، دیوارة محکم پاره می‌شود و باکتری زندگی تازه‌ای را از سر می‌گیرد.

فعالیتهای مفید باکتری

باکتری‌ها از راههای مختلفی بر زندگی آدمی‌تأثیر می‌گذارد. بعضی از آنها زیان آورند و باعث بروز بیماری می‌شوند و یا غذا و آب را آلوده می‌کنند در عوض بسیاری از باکتری‌ها مفیدند.

در واقع، زندگی بیشتر جانداران به وجود و فعالیت باکتری‌ها وابسته است.

تجزیه و پوسیدگی:باکتری‌هایی که زندگی ساپروفیتی دارند، به عنوان تجزیه کنندگان طبیعت شمرده می‌شوند. تجزیه کننده: به جانداری گفته می‌شود که بقایای بدن گیاهان و جانوران را تجزیه و به مواد ساده تر تبدیل می‌کنند.‌این مواد ساده، دوباره مورد استفاده سایر جانداران (به ویژه گیاهان) قرار می‌گیرند. به‌این ترتیب تجزیه کنندگان مواد را در طبیعت به گردش در می‌آورند و از بدون استفاده ماندن آنها جلوگیری می‌کنند. بعضی از باکتری‌ها فاضلابها را «گوارش» می‌دهند و تجزیه می‌کنند.

به‌این ترتیب، آب رودها و دریاچه‌ها را از آلودگی پاک می‌کنند.

تثبیت نیتروژن:بعضی از باکتری‌ها در ریشة گیاهانی مانند نخود. لوبیا ، یونجه و شبدر و گیاهان مشابه دیگر زندگی می‌کنند. از اجتماع‌این باکتری‌ها، گره‌هایی در ریشه چنین گیاهانی پدید می‌آید در داخل‌این گره‌ها نیتروژن هوا را با مواد دیگر ترکیب می‌کنند و موادی به نام نیترات می‌سازند که بسیار مورد استفاده گیاه قرار می‌گیرند و برای رشد آن لازمند.‌این عمل باکتری‌ها را تثبیت نیتروژن می‌گویند.

تولید غذا:ماست و پنیر، در نتیجه عملی که باکتری‌های ویژه در روی شیر انجام می‌دهند، تهیه می‌شود. از باکتری‌ها در تهیه کردن طعم کاکائو، چای و قهوه هم استفاده می‌شود.

استفاده در تحقیقات: باکتری‌ها ساختمان سلولی ساده دارند و به سرعت تکثیر می‌یابند.‌این خاصه‌ها، آنها را برای انجام تحقیقات آزمایشگاهی بسیار مناسب می‌کند. از باکتری‌ها در مطالعه روی سلولها و چگونگی عمل آنها و همچنین بیماری‌ها استفاده می‌شود. بعضی از باکتری‌ها برای تهیة داروهای مهمی‌مانند بعضی از آنتی بیوتیکها به کار می‌روند. واکسنهای مختلفی را هم به کمک باکتری‌های ضعیف شده یا مرده تهیه می‌کنند.

پایان نامه بررسی باکتری های احیاء کننده سولفات در عفونت های روده بزرگ و آپاندیسیت

اختصاصی از سورنا فایل پایان نامه بررسی باکتری های احیاء کننده سولفات در عفونت های روده بزرگ و آپاندیسیت دانلود با لینک مستقیم و پر سرعت .

فرمت فایل : WORD (قابل ویرایش)

تعداد صفحات:87

پایان نامه برای دریافت درجه کارشناسی ارشد در رشته زیست شناسی  (M.A)
گرایش: میکروبیولوژی

فهرست مطالب:
عنوان                                               شماره صفحه
چکیده    1
فصل اول: کلیات تحقیق
مقدمه    3
1-1- مورفولوژی روده بزرگ    4
1-1-1 سکوم و آپاندیس    4
1-1-2 کلون    5
1-2- بیماری¬های روده بزرگ    6
1-2-1 آپاندیسیت    6
1-2-2 عفونت¬های داخل شکمی    7
1-2-3 بواسیر    7
1-2-4 سرطان روده بزرگ    7
1-3- فلورروده    8
1-4- نقش¬های مهم فلور طبیعی روده    10
1-5- تاثیر آنتی بیوتیک¬ها برروی فلور روده    12
1-6- علایم خارج شدن توازن باکتری¬های روده    13
1-7- پروبیوتیک¬ها    13
1-8- منافع مصرف پروبیوتیک¬ها    13
1-9- اشکال پروبیوتیک¬ها    14
1-10- پری بیوتیک¬ها    14
1-11- باکتری¬های بی¬هوازی احیاکننده سولفات    15
1-12- نقش باکتری¬های احیا کننده سولفات در طبیعت    15
1-13- نقش باکتری¬های احیا کننده سولفات  در صنعت نفت    16
1-14- خوردگی میکروبی    16
1-15- واکنش¬های احیای ترموشیمیایی سولفات    17
1-16-  سیستم¬های آلوده به SRB    17
1-17- اهداف، فرضیات و پرسش اصلی پژوهش    18
1-17-1 اهداف اصلی    18
1-17-2 اهداف اختصاصی    18
1-17-3 اهداف کاربردی    18
1-17-4 فرضیات پژوهش    18
1-17-5 پرسش اصلی پژوهش    18
فصل دوم: پیشینه پژوهش
2-1- پژوهش¬های انجام گرفته در سطح جهان    20
2-2- پژوهش¬های انجام گرفته در ایران    23
فصل سوم: روش شناسی تحقیق
3-1- مواد و روش کار    25
3-2- محیط کشت مورد نیاز    26
3-3- انتخاب بیماران مورد نظر برای نمونه¬برداری    26
3-4- ارزیابی تاثیر آنتی بیوتیک ها برروی باکتری¬های  SRB    30
3-4-1 آنتی بیوتیک کلیندامایسین    30
3-4-2 آنتی بیوتیک جنتامایسین    31
3-4-3 آنتی بیوتیک مترونیدازول    31
3-5- ارزیابی خواص ضدمیکروبی آنتی بیوتیک¬ها بر باکتری¬های SRB مثبت    32
3-6- تعیین هویت مولکولی باکتری¬های SRB مثبت    33
3-7- آنالیز آماری    33


فصل چهارم: نتایج یافته های تحقیق
4-1- مقدمه    35
4-2- تجزیه و تحلیل نتایج جمعیت شناختی    35
4-2-1 جنسیت    36
4-2-2 سن    37
4-2-3 میزان تحصیلات    38
4-2-4 میزان درآمد    39
4-3- ارزیابی فرضیات پژوهش    40
4-3-1 فرضیه اول    40
4-3-2 فرضیه دوم    43
4-3-3 فرضیه سوم    45
4-3-4 فرضیه چهارم    47
4-3-5 فرضیه پنجم    48
4-3-6 فرضیه ششم    50
4-4- نتایج آزمایش  PCR    54
4-4-1 تأیید استخراج DNA    54
4-4-2 تأیید PCR ژن16S rRNA    55
4-4-3 توالی تعیین ترادف شده قطعه 16S rRNA    56
4-4-4 آنالیز فیلوژنتیکی    57
فصل پنجم: بحث و نتیجه گیری
5-1- بحث    63
5-2- نتیجه گیری    67
5-3- پیشنهادات    67
منابع و مآخذ    68
فهرست منابع فارسی    68
فهرست منابع انگلیسی    70
چکیده انگلیسی    73



فهرست جداول
عنوان                                               شماره صفحه
جدول 3-1: پرسشنامه مورد استفاده در این پژوهش    25
جدول 3-2: ترکیبات محیط کشت API    26
جدول 3-3: خصوصیات بالینی افراد انتخاب شده برای نمونه-برداری    28
جدول 4-1: توزیع فراوانی و افراد بر حسب جنسیت    36
جدول 4-2: فراوانی افراد مورد پژوهش بر حسب گروههای سنی    37
جدول 4-3: توزیع فراوانی و در پاسخ دهندگان بر حسب میزان تحصیلات    38
جدول 4-4: فراوانی افراد مورد پژوهش بر حسب میزان درآمد    39
جدول 4-5: فراوانی افراد مورد پژوهش بر حسب گروه های سنی و بیماری    40
جدول 4-6: ضریب همبستگی متغیرهای سن افراد و بیماری    42
جدول 4-7: فراوانی افراد مورد پژوهش بر اساس درامد و بیماری    43
جدول 4-8: ضریب همبستگی متغیرهای سن افراد و بیماری    44
جدول 4-9: فراوانی افراد مورد پژوهش بر اساس سابقه بیماری و بیماری    45
جدول 4-10: فراوانی افراد مورد پژوهش بر اساس جنسیت و سابقه مصرف آنتی¬بیوتیک    47
جدول 4-11: فراوانی افراد مورد پژوهش بر اساس گروه سنی و تحصیلات    48
جدول 4-12: ضریب همبستگی متغیرهای تحصیلات افراد و بیماری    49
جدول 4-13: فراوانی افراد مورد پژوهش بر اساس گروه های سنی وتاثیر آنتی¬بیوتیک¬ها    50
جدول 4-14: ضریب همبستگی متغیرهای سن و تاثیر داروی    51
جدول 4-15: ضریب همبستگی متغیرهای سن و تاثیر داروی جنتامایسین    52
جدول 4-16: ضریب همبستگی متغیرهای سن و تاثیر داروی مترونیدازول    53

 
فهرست نمودارها
عنوان                                               شماره صفحه
نمودار 4-1: فراوانی و نسبت افراد مورد پژوهش بر حسب جنس    36
نمودار 4-2: توزیع درصد نمونه آماری افراد برحسب سن    36
نمودار 4-3: فراوانی افراد مورد پژوهش  بر حسب میزان تحصیلات    38
نمودار 4-4: توزیع در صد نمونه آماری افراد  بر حسب میزان درآمد    39
نمودار 4-5: نمودار توافقی سن و بیماری آپاندیسیت    41
نمودار 4-6: فراوانی افراد مورد پژوهش بر اساس آپاندیسیت    41
نمودار 4-7: فراوانی افراد مورد پژوهش بر اساس درامد و بیماری    43
نمودار 4-8: فراوانی افراد مورد پژوهش بر اساس سابقه بیماری و بیماری آپاندیسیت    46
نمودار 4-9: فراوانی افراد مورد پژوهش بر اساس سابقه بیماری و بیماری عفونت روده    46
نمودار 4-10: فراوانی افراد مورد پژوهش بر اساس جنسیت و سابقه مصرف آنتی¬بیوتیک    47
نمودار 4-11:  فراوانی افراد مورد پژوهش بر اساس گروه سنی و تحصیلات    48
نمودا 4-12: ارزیابی تاثیر کیفی داروی کلیندامایسین بر باکتری¬های احیا کننده سولفات جدا شده از گروه¬های سنی    51
نمودار 4-13: ارزیابی تاثیر کیفی داروی جنتامایسین بر باکتری های احیا کننده سولفات جدا شده از گروه های سنی    52
نمودار 4-14: ارزیابی تاثیر کیفی داروی مترونیدازول بر باکتری¬های احیا کننده سولفات  جدا شده از گروه¬های سنی    53

 
فهرست شکل ها
عنوان                                               شماره صفحه
شکل 1-1: آپاندیس ملتهب و متورم (آپاندیسیت)    6
شکل 1-2: فلور طبیعی روده    10
شکل 3-1: مرحله جداکردن زائده آپاندیس    27
شکل 3-2: تلقیح باکتری¬های SRB)) به محیط مایع API    30
شکل 3-3: تاثیر آنتی بیوتیک¬ها بر رشد باکتری های SRB    32
شکل 4-1: تصویر الکتروفورز حاصل از DNA استخراج شده از باکتری.    54
شکل 4-2: تصویر الکتروفورز حاصل از تکثیر ژن 16S rRNA باکتری.    55


 
چکیده
باکتری¬های احیا کننده سولفات (SRB) گروه بزرگی از میکروارگانیسم¬های بی¬هوازی هستند که نقش بسیار مهمی در بسیاری از فرآیندهای بیوژئوشیمیایی ایفا می¬کنند. این پژوهش با هدف شناسایی وتعیین هویت مولکولی باکتری¬های احیا کننده سولفات و نقش آن¬ها در عفونت¬های روده بزرگ و آپاندیسیت در شهر کرمان انجام شد. روش کار: این پژوهش به صورت مقطعی-توصیفی در سال 1391 تا 1392 بر روی 50 بیمار مراجعه کننده به بیمارستان¬های مختلف شهر کرمان انجام شد. تمامی افراد مورد بررسی دارای مشکلات عفونت روده بزرگ ویا آپاندیسیت بودند. در بین این افراد نمونه¬گیری از حفره شکم و روده ی بزرگ انجام شد. سپس نمونه¬های تهیه شده به محیط کشت اختصاصی API تلقیح و 2 ماه در دمای 35 درجه سانتی گراد گرماگذاری شدند. سپس نمونه¬های مثبت پس از کشت مجدد در محیط جامد اختصاصیSRB ، برای خالص سازی بیشتر به محیط جدید API  منتقل گردید. شناسایی مولکولی جدایه ها با استفاده از پرایمر یونیورسال  16s rRNA و مقاومت آنتی بیوتیکی صورت گرفت. از مجموع نمونه¬های مورد پژوهش از6 مورد (12%) نمونه¬های مشکوک به SRB جداسازی گردید. اما با روش مولکولی در4 مورد (8%) باکتری های احیا کننده سولفات شناسایی شد. بیشترین گونه ی باکتری¬های (SRB) مربوط به سویه Desulfovibrio piger بود. همچنین بین جداسازی باکتری¬های SRB، سن و میزان تحصیلات افراد ارتباط معنی¬داری مشاهده شد مناسب¬ترین آنتی¬بیوتیک برای حذف باکتری¬های SRB کلیندامایسین شناسایی شد. با توجه به نقش احتمالی باکتری¬های SRB در  ایجاد سرطان کلون و عفونت¬های روده¬ای، ضرورت انجام پژوهش¬های تکمیلی و پایش مداوم بالینی در جمعیت¬های گسترده تر و ارزیابی نقش بیوسایدها وآنتی¬بیوتیک¬ها در حذف این باکتری¬ها وجود دارد.

واژگان کلیدی: باکتری¬های احیا کننده سولفات، عفونت¬های روده بزرگ، 16s rRNA



فصل اول:
کلیات تحقیق

مقدمه
باکتری¬های احیا کننده سولفات SRB به طور وسیعی در اقیانوس، آب¬های شیرین، لجن¬ها پراکنده¬اند. این باکتری¬ها از سولفات به عنوان پذیرنده نهایی الکترون استفاده و سولفید هیدروژن تولید می¬نمایند. تا اکنون 14 جنس از این گروه باکتری¬ها شناخته شده که به جز دسولفونما ویبرو تمامی آن¬ها گرم منفی می¬باشند. یک جنس از این باکتری¬ها به نام دسولفوویبرو می¬تواند در هنگام تکثیر فعال خود بیش از 10 گرم در لیتر سولفید هیدروژن تولید نماید (آبیارد 1382، 12-11؛ ;Geneva 2001, 157 Collette 1999, 198 ).
باکتری¬های SRB نقش مهمی را در شروع التهاب یا التهاب¬های دائمی از قبیل بیماری¬های دندان  ایفا     می¬کنند (;Langendijk 2000, 943-950 loubinoux et al 2003, 1304-1306 ). Desulphovibrio spp از آبسه¬های شکمی و آبسه¬های مغزی و همچنین از خون و ادرار نیز جدا شده¬اند (Collette 1999, 198). باکتری¬های SRB انرژی مورد نیاز خود را از احیای سولفات بدست می¬آورند این باکتری¬ها به دلیل تولیدH2s  که بجز ترکیبات سیتوتونیک  مهم است و یک عامل خورنده  می¬باشد (Barton 2007, 1-523) و در مجاری دستگاه گوارش (دهان و روده) انسان و حیوانات وجود دارند. یکی از آرکی متانوژنیک (متانوژن) به نام متانو بروی باکتراسمیتی  در عفونت¬های انسانی یافت شده است (Worden and Smelly 1996, 157-171 ) مهم ترین باکتری¬های احیاکننده سولفات شناسایی شده در فلور روده عبارتند از:
دسولفوتوماکولوم ، دسولفوویبریو ، دسولفوبولبوس ، دسولفوفیرفیلدنیس ، دسولفوویبریوپیگر  (Goldstein 2003, 2752-2754؛ La Scola and Raoult 1999, 3076-3077 ، Susceptibilities of  23 Desulfovibrio Isolates from Humans, 5308–5311 ).
براساس مطالعات Birvin در سال 2001 در کشور کانادا شیوع مشکلات گوارشی همراه با درد 6% گزارش کرد و در سال 2003 Ehlin و در سال 2004 Wilson در انگلستان شیوع عفونت را به ترتیب 2/8 درصد و 5/10 درصد گزارش کردند که از سال 1970 تا 2004 به طرز چشمگیری افزایش پیدا کرده است. Hugin در سال 2005 و Boivin در سال 2001 در ایالات متحده امریکا عفونت روده در بین دانش آموزان و در محدوده سنی بین 16 تا 30 سال در مردان 65 درصد و در زنان 44 درصد گزارش کردند.
در سال 1992، John، Boseph و همکاران ثابت کردند که منوباکتام¬ها (آزترونام) یا آمینوگلیکوزیدها به همراه کلیندامایسین یا مترونیدازول در کاهش (Intra abdominal infections) موثر می¬باشند (Yoshiota et al 1991, 11-17 ).
آنتی¬بیوتیک کلیندامایسین از دسته داروهای پادباکتری با نیمه عمر 2 تا 3 ساعت مانع از بیوسنتزپروتئین توسط باکتری می¬شود که در درمان پریتونیت، عفونت¬های داخل شکمی و همچنین عفونت¬های استافیلوکوکی مصرف می¬شود. مترونیدازول یکی از داروهای نیتروایمیدازول اثر کشندگی بر باکتری¬های  بی¬هوازی و پروتوزوآها دارد از این رو در درمان بیماری¬های التهابی، کولیت پسودو ممبراند و عفونت¬های ژیادریایی مصرف می¬شود (منصور 1390، 36-35؛ گوهرخانی 1374، 27؛ سیمون 1368، 18-17).
هدف از این پژوهش، ارزیابی نفش باکتری¬های احیا کننده سولفات در ایجاد عفونت¬های روده بزرگ و آپاندیسیت در شهر کرمان می باشد.

1-1- مورفولوژی روده بزرگ
روده بزرگ به طول 1.4 تا 1.8 متر، از انتهای روده باریک شروع شده و به مجرای مقعد ختم می¬شود. ابتدای روده¬ی بزرگ که در ارتباط با ایلئوم قراردارد، سکوم یا روده کور نامیده می¬شود. قسمتی ازروده بزرگ که بین سکوم وآنال کانال قراردارد، کولون نامیده می¬شود که به سه قسمت کولون مساعد، کولون افقی وکولون نازل، تقسیم می¬گردد. کولون نازل درانت ها به سیگموئیدورکتوم و نهایتاً آنال کانال، ختم می¬شود (جان ای 1389، 90-89).
1-1-1 سکوم و آپاندیس  
سکوم قسمت ابتدایی روده بزرگ است که زاییده آپاندیس به قسمت بن بست آن متصل می¬شود. آپاندیس زایده¬ی انگشت مانندی است به طول 10-5 سانتی¬متر وقطر متوسط 8/0 سانتیمتر که با افزایش سن قطر آن کاهش می¬یابد. دیواره آپاندیس مرکب از 4 لایه¬ای است که درسایر قسمت¬های لوله گوارش یافت          می¬شود. مخاط آپاندیس شبیه روده بزرگ، فاقد پرز وچین و حاوی غدد لوله¬ای مستقیم است. اپیتلیوم پوشاننده آن شامل سلول¬های جذب¬کننده و جامی است. آستروزیر مخاط حاوی تعداد زیادی عقده¬های لنفاوی است که با افزایش سن ازتعداد آنها کاسته می¬شود. در افراد سالخورده با ناپدیدشدن بافت لنفاوی درآپاندیس، مخاط وزیرمخاط فیبروزه میشوند. طبقه عضلانی در آپاندیس شبیه روده کوچک، مرکب از عضلات حلقوی درداخل وعضلات طولی درخارج است که از خارج بوسیله بافت سروز پوشیده شده است. آپاندیس یک عضو لنفاوی است و مانند دیگربافت¬های لنفاوی میتواند ملتهب شده وتولید آپاندیسیت نماید (جان ای 1389، 90-89).