(آشنایی با لمپس) - شبیه سازی DNA با نرم افزار لمپس (LAMMPS) به روش دینامیک مولکولی

اختصاصی از سورنا فایل (آشنایی با لمپس) - شبیه سازی DNA با نرم افزار لمپس (LAMMPS) به روش دینامیک مولکولی دانلود با لینک مستقیم و پر سرعت .

(آموزش lammps) در این آموزش مولکول DNA را به روش دینامیک مولکولی در داخل آب و یون شبیه سازی کردیم. در مورد مولکول دی ان آ توضیحاتی داده ایم. نحوه تولید دیتا فایل و فایل ورودی گام به گام توضیح داده شده است. در آخر سر از برنامه اجرا گرفته و با استفاده از VMD آن را نمایش داده ایم. میدان نیرو چارم (Force Field CHARMM) در این شبیه سازی استفاده  شده است. مدل آب نیز TIP3P می باشد. طول فیلم ۵۰ دقیقه با کیفیت HD می باشد.این آموزش توی لینوکس ابونتو تهیه شده و قابل انجام است.  تاریخ انتشار ۱۶ فروردین ۱۳۹۵

نحوه نصب نرم افزار لمپس (LAMMPS) بصورت موازی و سریال و اجرای یک مثال بصورت موازی و سریال

اختصاصی از سورنا فایل نحوه نصب نرم افزار لمپس (LAMMPS) بصورت موازی و سریال و اجرای یک مثال بصورت موازی و سریال دانلود با لینک مستقیم و پر سرعت .

در این آموزش شما یاد خواهید گرفت که چگونه نرم افزار شبیه سازی دینامیک مولکولی لمپس (LAMMPS) را هم بصورت موازی (Parallel) و هم سریال (serial) نصب کنید. دو روش برای شما ذکر خواهد شد که شما را قادر می سازد به آسانی این نرم افزار را رسم کنید و برنامه های خود را اجرا کنید. یک مثال هم در این آموزش بصورت موازی و هم بصورت سریال اجرا خواهد شد. کیفیت فیلم HD است.

شبیه سازی DNA با نرم افزار لمپس (LAMMPS) به روش دینامیک مولکولی

اختصاصی از سورنا فایل شبیه سازی DNA با نرم افزار لمپس (LAMMPS) به روش دینامیک مولکولی دانلود با لینک مستقیم و پر سرعت .

در این آموزش مولکول DNA را به روش دینامیک مولکولی در داخل آب و یون شبیه سازی کردیم. در مورد مولکول دی ان آ توضیحاتی داده ایم. نحوه تولید دیتا فایل و فایل ورودی گام به گام توضیح داده شده است. در آخر سر از برنامه اجرا گرفته و با استفاده از VMD آن را نمایش داده ایم. میدان نیرو چارم (Force Field CHARMM) در این شبیه سازی استفاده  شده است. مدل آب نیز TIP3P می باشد. طول فیلم ۵۰ دقیقه با کیفیت HD می باشد. تاریخ انتشار ۱۶ فروردین ۱۳۹۵