موضوع فارسی :تجزیه و تحلیل ژنومی و متابولومیک پیش بینی برای استاندارد سازی داده آنزیم
موضوع انگلیسی :<!--StartFragment -->
Predictive genomic and metabolomic analysis for the standardization of enzyme data
تعداد صفحه :9
فرمت فایل :PDF
سال انتشار :2014
زبان مقاله : انگلیسی
چکیده
IUBMB فهرست آنزیم می دهد یک کتابخانه ارزشمند از واقعیت های تجربی فرد در فعالیت های آنزیم، ارائه استاندارد کاتیون طبقه بندی و نامگذاری آنزیم. دانش تجربی در مورد روابط بین توالیهای پروتئینی آنزیم (یا سازه) و عملکرد خود (توانایی کاتالیز واکنش های شیمیایی) شده است در ادبیات عمومی و پایگاه داده ذخیره سازی. این یک روش مکمل برای استاندارد و سازماندهی داده آنزیم، به عنوان مثال، پیش بینی آنزیم ممکن است، واکنش و متابولیت های که باقی مانده به اد شناسایی تجربی فراهم می کند. بنابراین، ما ضرورت طبقه بندی آنزیم ها بر اساس شواهد و دیدگاه های مختلف به دست آمده از آثار مختلف تجربی نشان می دهد. KEGG (دایره المعارف کیوتو از ژن ها و ژنوم) پایگاه داده آنزیم از جهات مختلف از جمله توصیف؛ کاتیون آنزیم IUBMB نامگذاری / طبقه بندی فی (اعداد EC)، گروه شباهت واکنش آنزیم (KEGG کلاس واکنش؛ RCLASS) صرفا بر الگوهای تحول ساختار شیمیایی بر اساس، و گروه های شباهت ژن آنزیم (KEGG Orthology؛ KO) بر اساس ارتولوگ گروه هایی که می توان به مسیر KEGG و سلسله مراتب عملکردی BRITE نقشه برداری. برخی اورژانس شناسایی منحصر به فرد علاوه بر این به پایگاه داده KEGG غیر از شماره های EC ایجاد شده توسط IUBMB معرفی شدند. شماره R، RP و RC داده می شود به تشخیص واکنش، جفت واکنش دهنده و RCLASS بود. ژن، از جمله ژن آنزیم، دارای شماره ID خود را در خاص موجودات ج، و آنها اد طبقه بندی به دو گروه ارتولوگ که اد شناسایی توسط اعداد K هستند. در این بررسی، ما مفهوم و روش این فرمول با برخی از موارد به عنوان مثال بتن را توضیح دهد. ما پیشنهاد می کنیم آن را بنه مأمور به ایجاد یک طبقه بندی طرح کاتیون استاندارد که با هر دو فی تجربی مشخص و آنزیم تئوری پیش بینی شده می پردازد.